Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
曾经的一国之君意外身亡，穿越到魔法世界却成为手无缚鸡之力的婴儿？好吧，在壮阔而神秘的世界从零开始！比修炼更重要的是，他要先学会如何自己上厕所…离开襁褓成为强者，失去了尊贵王冠的他，用利剑为自己加冕！
东京——『晓特区』。
“你要代替你的妹妹给我生下我的孩子。”婚姻中没有爱情，我是这么想的。直到我发现了军人的挚爱——
22 岁的软件开发者萨姆·杨自幼便是狂热的游戏爱好者。学生时代全身心投入游戏开发，终于推出了酝酿已久的冒险解谜游戏《Luminate》！然而，当超人气游戏主播马歇尔·劳给出恶评后，她作为游戏开发者的前途骤然黯淡。更意外的是——马歇尔竟搬到了她隔壁！随着与马歇尔的相遇，萨姆与公司上司查尔斯·琼斯、发小兼常去咖啡馆的员工林肯·哈德森等人的关系也逐渐发生变化。在父母过度保护下长大、恋爱经验为零的萨姆，面对与男性突如其来的亲密接触不知所措，却也开始慢慢打破心防。这场以人生为赌注的终极挑战——萨姆能否成功通关！？
故事发生在艾雷西亚精灵学院之中，在这里学习深造的都是出身名门的千金大小姐们，她们要学会如何成为一名合格的精灵使。风早神人（古川慎 配音）是一名平凡的十六岁少年，一次意外之中，他撞见了少女克雷尔（木户衣吹 配音）出浴时的模样，又在误打误撞之中和她签订了契约，就这样，风早神人成为了学院之中唯一的男性精灵使。
东京夺还编、开戦。
