小丸子是一名小学二年级的女生，她活泼、好动、懒惰、什么事情都拖到最后一刻才做、学习不认真、成绩平平、经常和姐姐斗气、爱幻想、做事没恒心……在小丸子身上我们或多或少都看到了自己童年的影子。如果小丸子算是一个“怪人”的话，那么她的周围可谓“怪人”多多，有点神经质的班长丸尾同学、权利欲极强的女副班长、经常和小丸子一起疯的爷爷，讨人厌的宾治同学等等，这群性格各异、精力充沛的小孩、大人们，每天都在演绎着生活的趣事，伴随着小丸子一天天长大。
时间是1968年，当学生运动愈演愈烈之际，某大学的医学部出现了一个奇怪的男子。他有着黑白相间的头发，全身到处都是伤痕，而带着伤疤的脸也成为注册商标。这个男人为了获得医师资格证而学习，他的名字是间黑男，并且他通过自己天才的能力，创造了无数的奇迹。并且被后人称为黑杰克。
故事发生在市立里滨高中内，有原翼（西田望见 配音）是刚刚升上高中的校园新鲜人，曾经，身为棒球队队长的她对甲子园怀揣着无尽的希冀，但一场意外让她在心灰意冷之中放弃了梦想。如今的高中是一个没有棒球部的学校，虽然暗地里松了一口气，但有原翼同时还感到了小小的失望，难道棒球真的是她无法割舍的梦想吗？出生于棒球世家的傲娇大小姐东云龙（近藤玲奈 配音）、拥有魔鬼身材，个性温柔非常会照顾人的野崎夕姬（南早纪 配音）、个性活泼开朗的天然呆河北智惠（井上穗乃花 配音），在学校里，有原翼结识了这些对棒球充满了热情和兴趣的女孩子们。
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漫画《我与机器妹》TV动画化决定！
