小丸子是一名小学二年级的女生，她活泼、好动、懒惰、什么事情都拖到最后一刻才做、学习不认真、成绩平平、经常和姐姐斗气、爱幻想、做事没恒心……在小丸子身上我们或多或少都看到了自己童年的影子。如果小丸子算是一个“怪人”的话，那么她的周围可谓“怪人”多多，有点神经质的班长丸尾同学、权利欲极强的女副班长、经常和小丸子一起疯的爷爷，讨人厌的宾治同学等等，这群性格各异、精力充沛的小孩、大人们，每天都在演绎着生活的趣事，伴随着小丸子一天天长大。
台湾黑道正道会的朱雀部队专司暗杀，玻璃心（Glass Heart/G•H）正是组织一手培养的顶尖杀手，作风纤细精密，其谨慎程度甚至被人讥为胆小，却能一枪准确命中任何猎物的心脏，射程达六百米以上。在暗杀五十人后，第五十名猎物的女儿无心的几句童语让G•H终于崩溃，无法再继续作为杀人机器的生活。于是她从高楼跃下，让尖锐的铁栏杆贯穿自己心脏。另一方面犽羽獠总算要和槙村香结婚了，婚礼前夜阿香却为了救小孩而车祸身亡，按照阿香生前填写的器官捐赠遗愿，阿香的心脏就被捐了出去。没想到在运送过程竟然被劫，阿香的心脏于是阴错阳差地移植入G•H的身体里。 G•H的手术异常成功却迟迟没有醒来，她的意识在抗拒「醒来」这件事， 此时她的内心却响起了阿香的声音——器官移植有时会带有人生前的记忆感情——在阿香的鼓励与安慰下G•H终于苏醒，杀了组织看守人后潜逃，凭着记忆从台湾来到日本新...
故事背景设在明治64年，并由德川庆喜掌握权力的另一个日本。国家靠能量源「龙脉」，形成江户和科学混合的独特发展。但繁华背后，反体制派组织「蛇」正酝酿革命之火。德川政府委任暗组织「鵺」将其驱除。女主角-雪村笑羽在幼时被灭门，于是她作为「鵺」的处刑人，为报仇而持续寻找蛇野目……
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“魔法少女实力强，颜值高，动作灵活，是一个令人羡慕的职业，人人都羡慕，待遇优厚，而且很受欢迎。”
五十岚抛弃过去，为了逃离社会而移居鹿儿岛县“トカラ列岛”。在被称为“日本最后的秘境”的“火之岛”相遇的，是岛上唯一的中学生とんぼ。天真烂漫的少女，隐藏着意想不到的高尔夫才能！？以这次相遇为契机，两人的命运发生了很大的变化…。
故事发生在一座位于孤岛之上的学校里，在这里学习的，都是身怀绝技的超能力者。这些孩子们被告知，在不久后的将来，即将发生灾厄，为了能够应对来袭的“人类之敌”，他们必须在这与世隔绝的孤岛上接受生存训练。
