三十年前, Ray Reiter 亲眼目睹了双亲被一只巨型章鱼杀死, 他戳瞎了章鱼的一直眼睛, 不过还是让那怪物逃走了. 现在,那只巨型章鱼又出现并袭击了一个寻找宝藏的探险小队. Ray Reiter 加入了这个小队, 希望再次碰上那怪物并亲手了结它.
故事描述杰西卡(德汪达·怀斯 DeWanda Wise 饰)带着家人回到老家时，发现了她小时候的熊布偶「巧芯」，而她的继女爱丽丝(派珀·布劳恩 Pyper Braun 饰)很快就跟这个 布偶变得形影不离，然而，随着爱丽丝跟巧芯玩的游戏内容越来越疯狂，杰西卡才意识到它可能不是单纯的熊布偶……
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某夜，香港一个幽暗的死角，而发生一件变态的奸杀案，死者的舌头被割去，死状恐怖，而同类的谋杀案却接二连三地发生，竟将刚由大陆抵步的柴华娃也卷进这恐怖的漩涡中……
将齐聚第一部中扮演变态医生的戴特·莱瑟和第二部中饰演痴肥狂男的劳伦斯·R·哈维，而希克斯导演则想把戏中戏玩到底，他将在第三部中扮演他自己。而《人体蜈蚣3》也将会重新生成出一个反面角色。09年《人体蜈蚣》中由戴特·莱瑟塑造的拥有阴森面容的大反派，首创三人连体试验，11年《人体蜈蚣2》在争议中上映，而《人体蜈蚣3》中两位反派齐聚，还有导演亲身上阵，其重口程度可想而知。
拉瑟在片中饰演一位性格暴躁的典狱长，他统领的这所州立监狱的囚犯暴动次数、医疗支出和狱警调动次数全都排名全国第一。更关键的是，他认为这些囚犯和州长(罗伯茨饰演)没有给他应有的尊重。他尝试过许多惩罚手段，依然无法让这些囚犯守规矩，州长也给他下达了最后通牒：要么就管好囚犯，要么就关掉监狱。在自己得力助手德怀特(劳伦斯饰演)的建议下，他想出了一个极具“创意”的想法，这样可以管理好囚犯，还能省下数百万美元，而这个创意正是来自于《人体蜈蚣》电影
精神病院女病人郭少芳（周秀娜 饰）无故怀孕，警方着手对这一案件展开调查。调查结果出乎意料，少芳这次流产与一年前流产日期完全相同，更让人称奇的是两个胎儿都是一年前被杀男医生李意祥（黎诺懿 饰）的骨肉，并且两个胎儿DNA排列完全相同的报告说明两个胎儿是同一生命。在警方的调查过程中，一个让人匪夷所思的故事逐渐露出端倪：女护士郭少芳爱上已婚男医生李意祥，于是施计换掉男医生之妻沈绿萍的安胎药，致使沈绿萍三个月大的胎儿流产，夫妻关系从此恶化。郭少芳如愿和李意祥在一起了，可是恐怖的事情却接二连三在她身边发生……
在德克萨斯州亨茨维尔小镇，有一桩强奸并谋杀 9 岁女孩的案件尚未侦破。一名被定罪的前科犯杰克已从监狱释放，因为新的 DNA 证据证明他不在犯罪现场。但是，当杰克获释后，另一名小女孩被残忍杀害时，镇上的人都将矛头指向了这名前科犯。当杰克努力洗清自己的名声时，这座努力掩盖秘密的小镇上出现了新的嫌疑人。
皮特（James Caviezel 饰）和卡拉（Claudia Karvan 饰）是一对生活在澳大利亚的年轻夫妇，他们的生活优渥，然而两人却因种种原因感情失和，婚姻濒临破裂。皮特为弥合这段感情，决定利用周末带着妻子去莫娜海滩度假。
