本作讲述了来自遥远天体M421的布雷泽奥特曼与地球防卫军成立的特殊怪物应对小队SKaRD队长根托·希尔玛坚强的内心产生共鸣，并与之成为一体的故事。 。
改编自山下文吾的同名漫画作品，以人兽共同存在的西顿学园为故事背景，讲述了在有着各式各样动物的西顿学园里，种族数量最少的人类少年间样人暗恋着同为人类的小瞳，却阴差阳错被北海道狼兰华所纠缠，一场动物恋爱喜剧就这样开始了。
一切的开始追溯到1987年9月，在日本某处发生的离奇事件。事件发生之后的10多年来一直和未知的威胁对抗的火岛博士和与那岭博士组成了开发小组并在双神岛建设了研究所，著手进行地球制弹劾凰机械人的开发计划。多年后，终于完成了称之为“素体”的机械人原型机体。但是，就在这时候，主张此后的量产计画应以生产导向及效率为优先的无人驾驶机械人的火岛博士和为了防止万一机械人不听指挥发狂时的危险性的有人驾驶机械人的与那岭博士之间产生对立。经过长久激烈的争论后，火岛博士的提案因为危险性太高的理由被驳回而决定生产有人驾驶的机械人。火岛博士同时也被逐出研究所。
